Aspectos generales
Responsable
Métodos de evaluación
| Método |
Cantidad |
Porcentaje |
| Examen |
3 |
75% |
| Participación en clase, entrega de tareas |
1 |
25% |
Integrantes
| Integrante |
Rol |
Horas |
Actividad complementaria |
| CEVALLOS GAOS ANA MARÍA |
Responsable |
28.00 |
|
| RODRÍGUEZ SANOJA ROMINA MA. DE LA PAZ |
Coordinador tutor |
16.00 |
|
| RAMÍREZ REIVICH OCTAVIO TONATIUH |
Profesor invitado (MDCBQ) |
4.00 |
|
| DANIEL ALEJANDRO GUILLÉN SANTOS |
Profesor invitado (Externo) |
12.00 |
|
| KARINA ADAME BEAS |
Profesor invitado (Externo) |
4.00 |
|
Introducción
“Herramientas de biología molecular en biotecnología” es un curso en donde se revisan las técnicas básicas empleadas en biología molecular, tanto de forma teórica como a través del desarrollo de ejercicios “in silico”. Se busca que el alumno revise aspectos básicos de biología molecular, aprenda el manejo de software básico para la manipulación de secuencias de ADN y entienda como este conocimiento ha sido explotado para convertirlo en herramientas de gran utilidad para el desarrollo biotecnológico. Una parte importante del curso revisa las metodologías y programas más empleados en clonación y expresión de genes heterólogos ya que, la mayoría de los alumnos interesados en tomar este curso tendrán que utilizar estas técnicas durante el desarrollo de sus proyectos.
Objetivos
Que el alumno entienda los principios básicos de las técnicas de biología molecular más empleadas, que pueda utilizar este conocimiento para el mejor desarrollo de su proyecto y que pueda identificar y resolver los problemas más frecuentes que se presentan durante su uso.
Temario
1. Manejo de secuencias (teórico e in silico)
a. Formateado de secuencias
b. Manejo de secuencias (sentido, antisentido, reversa complementaria)
c. Análisis de cromatogramas
d. Blast
e. Marcos de lectura
f. Traduccción
2. PCR y diseño de primers (teórico e in silico)
a. Marco teórico
b. Diseño de primers
c. Cálculo de Tm y estructuras secundarias en diferentes programas
d. cDNA para clonación
3. RT-PCR (teórico e in silico) parte 1
a. Introducción y Fundamentos de PCR en Tiempo Real
b. Sistemas de detección (SYBR Green y Taqman)
c. Curvas estándar
d. Construcción de una curva estándar
e. Teoría del análisis de la curva de fusión
f. Análisis de los resultados de la PCR en tiempo real de SYBR Green: análisis de la curva de fusión
4. RT-PCR (teórico e in silico) parte 2
a. Identificar los factores que afectan el éxito de las reacciones de PCR en tiempo real:
b. Eficiencia de amplificación
c. Impacto de la eficiencia de un ensayo de PCR en los resultados de cuantificación
d. Papel de la eficiencia de amplificación en la validación de ensayos
e. Diseño y síntesis de cebadores y sondas
f. Aplicaciones de PCR en Tiempo Real
5. Plásmidos
a) Identificación de componentes plásmido (Ori, alfa-complementación, promotor, terminador, genes de selección)
b) Obtención y caracterización de plásmidos
c) Vectores de clonación de productos PCR Clonación (teórico e in silico).
6. Clonación por restricción
a) Enzimas de Restricción
b) Clonación con enzimas de restricción
7. Clonación independiente de ligasa (teórico e in silico)
a) T4 DNA polimerasa
b) Ensamblaje de Gibson
8. Expresión heteróloga de proteínas en E.coli
a) Vectores de expresión en E. coli: promotores, terminadores, marco de lectura, etiquetas, inteínas
b) Purificación de proteína recombinante
c) Glicosilación
9. Expresión de genes heterólogos en células eucariontes (insectos, CHOs)
10. Mutación puntual
11. Recapitulación y ejercicios Clonación
Descargables
