Contacto
Campos de conocimiento
Biofísica
Bioquímica
Reconocimiento Molecular y Bioestructura
Líneas de investigación
Biología Estructural Basada en Cristalografía de Proteínas y otros métodos estructurales.
La Biología Estructural ha sido de fundamental importancia, participando de manera decisiva en la generalización de la concepción de una Biología basada en descripciones moleculares, lo que ha llevado al desarrollo de la biotecnología moderna, de la ingeniería genética, y de la genómica. Hoy día, fenómenos tan diversos como la contracción muscular, la biosíntesis de proteínas, la catálisis y la regulación enzimáticas cuentan con descripciones atómicas de razonable detalle.
La biología estructural utiliza un conjunto de técnicas que abarcan técnicas de determinación estructural (cristalografía de macromoléculas y resonancia magnética nuclear), de modelización molecular y de simulaciones (dinámica molecular, métodos montecarlo, entre otros). En nuestro laboratorio se utilizan algunas de estas técnicas: en particular, en determinación de estructuras usamos la cristalografía de macromoléculas.
Por diversas razones, la biología estructural se ha desarrollado muy lentamente en toda Latino América, aún comparando con el desarrollo de otras ramas de la biología y de la biotecnología. Basta decir que los grupos de Latinoamérica con publicaciones en cristalografía de macromoléculas no llegan a la decena. Por eso nuestro grupo ha debido asumir el reto de seleccionar una serie de proyectos de interés y simultáneamente colaborar con otros laboratorios en la formación de recursos humanos en el área de biología estructural. Hemos buscado abarcar una cierta diversidad de temas, que permitirá, en un plazo corto, generar varias líneas de investigación en biología estructural en México, comprendiendo proyectos tanto básicos como con aplicaciones biotecnológicas.
Publicaciones
Miranda-Blancas,R., Garcia-Gutierrez,P., Sanchez-Juarez,C., Cardona Echavarria,M.C., Flores-Lopez,R., Zubillaga,R.A., Rodriguez-Lima,O., Sanchez Perez,L.C., Rudino-Pinera,E., Landa,A. (2025). Structural insights into sigma class glutathione transferase from Taenia solium: Analysis and functional implications. PLoS Neglected Tropical Diseases, 19 (5), e0013
Almeida-Juarez,A.G., Chodankar,S., Pardo-Lopez,L., Zavala-Padilla,G., Rudino-Pinera,E. (2025). Investigating the quaternary structure of a homomultimeric catechol 1,2-dioxygenase: An integrative structural biology study. PLoS ONE, 20 (5), e0315992.
Campuzano-Gonzalez,A., Gil-Rodriguez,P., Quintana-Armas,A.X., Guerra,Y., Perez,Y., Rudino-Pinera,E. (2025). Structural determination of a new non-canonical inhibition complex between porcine trypsin and M271 a potato Kunitz-STI inhibitor. Biochemical and Biophysical Research Communications, 768, 151818.
Sanchez-Juarez,C., Sanchez-Perez,L.C., Zubillaga,R.A., Flores-Lopez,R., Landa,A., Jimenez,L., Miranda-Blancas,R., Rudino-Pinera,E., Cardona-Echavarria,M.C., Garcia-Gutierrez,P. (2025). Effect of Glutathione on the Stability, Dynamics and Catalysis of Two Different Classes of Glutathione Transferases from Taenia solium. Journal of the Mexican Chemical Society, 69 (1), 39-47.
Valiente,P.A., Guerra,Y., Wolf,M.G., Pascual,I., Rudino-Pinera,E., Florent,I., Pons,T., Groenhof,G. (2025). Discovery of a Noncompetitive Open-Flap Selective Inhibitor of Plasmepsin II with Antiplasmodial Activity. Journal of chemical information and modeling, 65 (4), 2038-2051.
Cardona-Echavarria,M.C, Santillan,C, Miranda-Blancas,R, Stojanoff,V, Rudino-Pinera,E (2024). Unveiling success determinants for AMB-assisted phase expansion of fusion proteins in ARP/wARP. Journal of Structural Biology, 216 (2), 108089.
Miranda-Blancas,R., Rodriguez-Lima,O., Garcia-Gutierrez,P., Flores-Lopez,R., Jimenez,L., Zubillaga,R.A., Rudino-Pinera,E., Landa,A. (2024). Biochemical characterization and gene structure analysisA?of the 24-kDa glutathione transferase sigma from Taenia solium. FEBS Open Bio, Mar 21 [Online ahead of print].
Uribe-Vazquez,B., Diaz-Vilchis,A, Avila-Linares,A., Saab-Rincon,G, Marin-Tovar,Y., Flores,H, Pastor,N, Huerta-Miranda,G, Rudino-Pinera,E., Soberon,X (2024). Characterization of a catalase-peroxidase variant (L333V-KatG) identified in an INH-resistant Mycobacterium tuberculosis clinical isolate. Biochemistry and Biophysics Reports, 37, 101649.
Millan-Pacheco,C., Arreola,R., Villalobos-Osnaya,A., Garza-Ramos,G., Serratos,I.N., Diaz-Vilchis,A., Rudino-Pinera,E., Alvarez-Sanchez,M.E (2023). A Putative New Role of Tv-PSP1 Recognizes IRE and ERE Hairpin Structures from Trichomonas vaginalis. Pathogens, 12 (1), 79.
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Melendez-Zempoalteca,A., Juarez-Gonzalez,V.R., Rudino-Pinera,E., Pastor,N., Vargas-Jaimes,L., Valcarcel-Gamino,J.A., Vazquez-Vuelvas,O.F., Quintero-Hernandez,V., Valdez-Velazquez,L.L. (2022). Antivenom Derived from the Ct1a and Ct17 Recombinant Toxins of the Scorpion Centruroides tecomanus. International Journal of Peptide Research and Therapeutics, 28 (5), 133.
Miranda-Blancas,R., Avelar,M., Rodriguez-Arteaga,A., Sinicropi,A., Rudino-Pinera,E. (2021). The B -hairpin from the Thermus thermophilus HB27 laccase works as a pH-dependent switch to regulate laccase activity. Journal of Structural Biology, 213 (2), 107740.
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Rodriguez-Salazar,J. Almeida-Juarez,A.G. Ornelas-Ocampo,K. Millan-Lopez,S. Raga-Carbajal,E. Rodriguez-Mejia,J.L. Muriel-Millan,L.F. Godoy-Lozano,E.E. Rivera-Gomez,N. Rudino-Pinera,E. Pardo-Lopez,L. 2020. Characterization of a Novel Functional Trimeric Catechol 1,2-Dioxygenase From a Pseudomonas stutzeri Isolated From the Gulf of Mexico Frontiers in Microbiology, 11, 1100.
Ortiz-Soto,M.E. Porras-Dominguez,J.R. Rodriguez-Alegria,M.E. Morales-Moreno,L.A. Diaz-Vilchis,A. Rudino-Pinera,E. Beltran-Hernandez,N.E. Rivera,H.M. Seibel,J. Lopez-Munguia,A. 2020. Implications of the mutation S164A on Bacillus subtilis levansucrase product specificity and insights into protein interactions acting upon levan synthesis International Journal of Biological Macromolecules, 161, 898-908.
Cifuentes-Castro,V.A. Rodriguez-Almazan,C. Silva-Sanchez,J. Rudino-Pinera,E. 2020. The crystal structure of ESBL TLA-1 in complex with clavulanic acid reveals a second acylation site Biochemical and Biophysical Research Communications, 522, 545-551.
