Biología Estructural Basada en Cristalografía de Proteínas y otros métodos estructurales.

La Biología Estructural ha sido de fundamental importancia, participando de manera decisiva en la generalización de la concepción de una Biología basada en descripciones moleculares, lo que ha llevado al desarrollo de la biotecnología moderna, de la ingeniería genética, y de la genómica. Hoy día, fenómenos tan diversos como la contracción muscular, la biosíntesis de proteínas, la catálisis y la regulación enzimáticas cuentan con descripciones atómicas de razonable detalle.
La biología estructural utiliza un conjunto de técnicas que abarcan técnicas de determinación estructural (cristalografía de macromoléculas y resonancia magnética nuclear), de modelización molecular y de simulaciones (dinámica molecular, métodos montecarlo, entre otros). En nuestro laboratorio se utilizan algunas de estas técnicas: en particular, en determinación de estructuras usamos la cristalografía de macromoléculas.
Por diversas razones, la biología estructural se ha desarrollado muy lentamente en toda Latino América, aún comparando con el desarrollo de otras ramas de la biología y de la biotecnología. Basta decir que los grupos de Latinoamérica con publicaciones en cristalografía de macromoléculas no llegan a la decena. Por eso nuestro grupo ha debido asumir el reto de seleccionar una serie de proyectos de interés y simultáneamente colaborar con otros laboratorios en la formación de recursos humanos en el área de biología estructural. Hemos buscado abarcar una cierta diversidad de temas, que permitirá, en un plazo corto, generar varias líneas de investigación en biología estructural en México, comprendiendo proyectos tanto básicos como con aplicaciones biotecnológicas.

Publicaciones

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Rodriguez-Salazar,J., Almeida-Juarez,A.G., Ornelas-Ocampo,K., Millan-Lopez,S., Raga-Carbajal,E., Rodriguez-Mejia,J.L., Muriel-Millan,L.F., Godoy-Lozano,E.E., Rivera-Gomez,N., Rudino-Pinera,E., Pardo-Lopez,L. (2020). Characterization of a Novel Functional Trimeric Catechol 1,2-Dioxygenase From a Pseudomonas stutzeri Isolated From the Gulf of Mexico. Frontiers in Microbiology, 11, 1100.
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Ramirez-Carreto,S., Vera-Estrella,R., Portillo-Bobadilla,T., Licea-Navarro,A., Bernaldez-Sarabia,J., Rudino-Pinera,E., Verleyen,J.J., Rodriguez,E., Rodriguez-Almazan,C. (2019). Transcriptomic and Proteomic Analysis of the Tentacles and Mucus of Anthopleura dowii Verrill, 1869. Marine Drugs, 17 (8), E436.
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Zarate-Romero,A., Stojanoff,V., Cohan,A.E., Hansberg,W., Rudino-Pinera,E. (2019). X-ray driven reduction of Cpd I of Catalase-3 from N. crassa reveals differential sensitivity of active sites and formation of ferrous state. Archives of Biochemistry and Biophysics, 666, 107-115.
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