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Campos de conocimiento
Bioinformática
Ciencias Genómicas
Microbiología Molecular
Líneas de investigación
EVOLUCIÓN, GENÓMICA Y ECOLOGÍA DE BACTERIÓFAGOS Y BACTERIAS. Mi investigación consiste en explicar aspectos fundamentales de la interacción de bacteriófagos con bacterias a nivel molecular y en comunidades. Me interesa comprender la diversidad genómica y filogenética, los mecanismos de entrada de fagos, el equilibrio entre la lisis y la lisogenia en las comunidades, así como los procesos co-evolutivos implicados en la adaptación de los fagos en las comunidades bacterianas.
Publicaciones
• Santamaría, R. I., Bustos, P., Van Cauwenberghe, J., and González, V., 2021. Hidden diversity of double-stranded DNA phages in symbiotic Rhizobium species. Philosophical Transactions of the Royal Society B. Doi: 10.1098.2020-0468. Accepted.
IF: 6.23, Q1.
• Van Cauwenberghe, J., Santamaría, R.I., Bustos, P. Juárez, S., Duchi, M. A., Fleming, M. T., Etcheverry, A., González, V., 2021. Spatial patterns in phage-Rhizobium coevolutionary interactions across regions of common bean domestication. ISME J. https://doi.org/10.1038/s41396- 021-00907-z
IF: 9.18, Q1.
• Balderas-Ruíz, K.A., Bustos, P., Santamaría, R.I. González, V., et al. 2020. Bacillus velezensis 83 a bacterial strain from mango phyllosphere, useful for biological control and plant growth promotion. AMB Express 10, 163. https://doi.org/10.1186/s13568-020-01101-8.
IF: 2.49, Q3.
• López-Leal, G., Santamaría, R. I., Cevallos, M. A:, González, V., and Castillo, S. 2020. Prophages encode antibiotic resistance genes in Acenitobacter baumanii. Microbial Drug Resistance. DOI: 10.1089/mdr.2019.0362.
IF: 2.29, Q3.
• Cabrera-Contreras R., Santamaría R.I., Bustos P., Martínez-Flores I., Meléndez E., Morelos R., Barbosa- Amezcua M., González-Covarrubias V., Silva-Herzog E., Soberón X., González V. 2019. Genomic analysis of prevalent Staphylococcus epidermidis multi-drug resistant strains isolated from a Children’s Hospital in México City in an eight years survey. PeerJ, 7: e8068. DOI: 10.7717/peerj.8068. JCR Journal IF: 2.35. ISSN: 2167-8359.
IF: 2.37, Q2.
• González V., Santamaría R.I., Bustos P., Pérez-Carrascal O.M., Vinuesa P., Juárez S., Martínez-Flores I., Cevallos M.A., Brom S., Martínez-Romero E., Romero D. 2019. The phylogenomic species of Rhizobium are structured by a continuum of diversity and genomic clusters. Frontiers in Microbiology, April 30, 10:910. DOI: 10.3389/fmicb.2019.00910. JCR Journal IF: 4.25. ISSN:1664-302X.
IF: 4.23, Q2.
• Sigala, JC, Suárez, BP, Lara, AR, Le Borgne, S, Bustos, P, Santamaría, RI, González, V, and Martínez, A, 2017. Genomic and physiological characterization of a laboratory isolated Acenitobacter schindleri ACE strain that quickly and efficiently catabolizes acetate. Microbiology, DOI 10.1099.
IF: 2.1, Q3.
• Santamaría, RI., Bustos, P., Pérez-Carrascal, OM., Miranda-Sánchez, F., Vinuesa, P., Martínez, I., Juárez, S., Lozano, L., Martínez-Romero, E., Cevallos, MA, Romero, Dávila, G., Ormeño-Orrillo, E., and González, V., 2017. Complete genome sequences of eight Rhizobium symbionts associated with common bean (Phaseolus vulgaris). Genome Announcements 5 (999): e00645-17.
• Bustos P, Santamaría RI, Pérez-Carrascal OM, Acosta JL, Lozano L, Juárez S, Martínez-Flores I, Martínez-Romero E, Cevallos MÁ, Romero D, Dávila G, Vinuesa P, Miranda F, Ormeño E, González V. 2017. Complete Genome Sequences of Three Rhizobium gallicum Symbionts Associated with Common Bean (Phaseolus vulgaris). Genome Announcements. 16; 5(11). pii: e00030-17. doi: 10.1128/genomeA.00030-17. PMID: 2830277.
• Pérez-Carrascal, OM., VanInsberghe, D., Juárez, S., Polz, M., Vinuesa, P., González, V. 2016. Population genomics of the symbiotic plasmids of sympatric nitrogen-fixing Rhizobium species associated with Phaseolus vulgaris. Environmental Microbiology, 18(8):2660-76. doi: 10.1111/1462-2920.13415. ISSN-1462-2920.
IF: 4.91, Q1.
