Identificar principios generales de la regulación transcripcional en bacterias y cómo reconfiguran su metabolismo ante cambios en el ambiente para poder sobrevivir. Identificar metabolitos que actúen como señales en comunidades bacterias, o entre plantas y bacterias en simbiosis.
Para nuestra investigación utilizamos integración de datos ómicos, desarrollo de herramientas bioinformáticas y validaciones experimentales.

Publicaciones

Ledezma-Tejeida D, Schastnaya E, Sauer U. 2021. “Metabolism as a signal generator
in bacteria”. Current Opinion in Systems Biology, 28:100404. Índice de impacto: 3.7

Pontrelli S, Szabo R, Pollak S, Schwartzman J, Ledezma-Tejeida D, Cordero O.X, Sauer U. 2021. “Metabolic cross-feeding structures the assembly of polysaccharide degrading communities”. Science Advances, 8 (8) Índice de impacto: 14.13

Ledezma-Tejeida D, Altamirano-Pacheco L, Fajardo V, Collado-Vides J. 2019. “Limits to a classic paradigm: most transcription factors in E. coli regulate genes involved in multiple biological processes”. Nucleic Acids Research, 47 13: 6656-6667. Índice de impacto: 14.9

Salgado H, Gama-Castro S, Lara P, Mejia-Almonte C, Alarcón-Carranza G, López- Almazo AG, Betancourt-Figueroa F, Peña-Loredo P, Alquicira-Hernández S, Daniela Ledezma-Tejeida, et al. “RegulonDB v12.0: a comprehensive resource of transcriptional regulation in E. coli K-12”, Nucleic Acids Research, Volume 52, Issue D1,5 January 2024, Pages D255–D264 Indice de impacto: 14.9

Femerling G, Gama-Castro S, Lara, P, Ledezma-Tejeida D, Tierrafría VH, Muñiz LJ, Bonavides-Martínez C, Collado-Vides J. 2021. “Sensory systems and transcriptional regulation in Escherichia coli”. Frontiers in Bioingeneering and Biotechnology, 108. Ìndice de impacto: 6

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